Перед цистоскопией проводится катетеризация мочевого пузыря. Через катетер мочевой пузырь опорожняется и промывается и наполняется стерильным раствором, чтобы расправить стенки и обеспечить хороший обзор. Затем через уретру аккуратно вводится цистоскоп.
В некоторых случаях цистоскопию проводят через разрез брюшной стенки и после фиксации мочевого пузыря, на нем делают небольшой разрез, через который вводят цистоскоп.
Процедура занимает от 20 до 40 минут.